东都、西都、北都的战争结束后，在潘多拉魔塔内建立起了新政府，各都由三位都长管理。然而这三位都长却在就职演讲上扬言要歼灭创骑，一场新的危机降临了，战兔最后的实验开始了！

在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！

「来吧，开始实验吧。」 行星探测船从火星带回的神秘之箱“潘多拉魔盒”。 从箱中释放出来的能量创造出了巨大的墙壁，日本从此被分成了三部分。 10年后，在谜之怪人“猛击者”暗中活动的东都街头，传说存在着为了保护人们而战斗的假面骑士创骑。 他的真身是丧失记忆的天才物理学家·桐生战兔。为了解开潘多拉魔盒之谜，为了取回自己的记忆，他的战斗拉开了序幕……

「来吧，开始实验吧。」 行星探测船从火星带回的神秘之箱“潘多拉魔盒”。 从箱中释放出来的能量创造出了巨大的墙壁，日本从此被分成了三部分。 10年后，在谜之怪人“猛击者”暗中活动的东都街头，传说存在着为了保护人们而战斗的假面骑士创骑。 他的真身是丧失记忆的天才物理学家·桐生战兔。为了解开潘多拉魔盒之谜，为了取回自己的记忆，他的战斗拉开了序幕……

泊进之介使用MachDriver炎及TridoronKey变身的全新姿态－超(Super)DeadHeatDrive披露！看似是DrivetypeSPEED组合魔进Chaser而成的战损型外貌。另外，东映的白仓P预告表示Drive总有一天完结。大概1、2年没有做过的事，或许在这部剧场版中，继Drive之后的新骑士(Ghost)将会亮相！为了保护市民，今日也继续战斗的假面骑士Drive=泊进之介。突然，一位称进之介做「父亲」的青年在面前出现。他的名字叫泊英治。来自未来的英治目的是向父亲・进之介警告。2015年8月5日，腰带桑=DriveDriver开始暴走，成为契机一年后Roidmude征服世界。进之介无法相信，但英治的「预言」说中了，DriveDriver发生异常。因为大规模的破坏行为，市民的英雄・Drive成为了全国通缉犯。根据英治所说，腰带桑的<Drive系统>本身就是克里姆博士为了毁灭人类而策划的程式。并且在这危机的旋涡中，从未来追踪英治，驾驶NEXTridoron的神秘战士・DarkDrive出现！压倒性的力量击败Mach和Chaser。前所未有的强大敌人，迫近中的最坏未来......一直以来，任何时候都一起战斗的<拍档>成为了人类最大的威胁。剩下的路只有一条，唯有由自己对<拍档>动手。为了未来、守护人类，被逼决断的进之介终於亲手把DriveDriver.....

和平年代，继承了假面超人月骑衣钵的少年红渡进入森罗高中，开始了磕磕绊绊的校园生活。某天，一名仓皇落魄的越狱犯闯入高中，此人名叫杉村隆，是一个历经22年岁月未见衰老的奇怪之人。一阵混乱过后，杉村隆被觉醒的传说偶兽带走。从白峰天斗的口中得知，杉村不老的秘密极可能和22年前其亲手策划的劫持女子音乐家的事件有关，而这一切导致了最为恐怖的上古魔王传说偶兽复活。 为了粉碎传说偶兽的阴谋，红渡穿越时空回到了1986年，并且见到了自己的父亲红音也。他与父亲试图改变历史，然而一切依旧朝着最糟糕的事态发展……

灯光闪烁的大都市内，一股彩虹色的龙卷风突然降临。幕后黑手金色魔法师抓走了阿历，操真晴人为了救阿历，与金色魔法师展开了对决，他们最终都被卷入了龙卷风之中。 当操真晴人和阿历苏醒后发现，整个世界都变成了魔法国度。人们通过变身腰带和魔法指环随心所欲地使用魔法，魔法是人们生活中不可或缺的东西。虽然城市里也有幻魔出来作乱，但每一个市民都可以利用腰带变身成假面骑士进行反抗，这让操真晴人和阿历大为震惊。 操真晴人和阿历因身份可疑，遭到了大门凛子逮捕。随后，他们两个被送到了城堡，去面见魔法王国的统治者玛雅大王。 看似平静的奇特魔法世界里，其实暗藏着一个惊天大阴谋。操真晴人将如何找到金色魔法师、拯救众人，并带着阿历回到原来的世界呢？

故事以TV版为基础，战斗所剩下的骑士只有六人：城户真司、秋山莲、北冈秀一，浅仓威，雾岛美穗和一位神秘骑士。雾岛美穗成为假面骑士骑士的目的是要杀死浅仓为姐姐报仇，并让姐姐复活。 为了报仇的美穗不理真司的阻止，仍多次与浅仓战斗，却反而令自己陷入危机，当浅仓向美穗下毒手时，龙牙突然出现解救美穗，并以强大的力量将王蛇压倒 ，令美穗成功杀死浅仓。 由于美穗以为是真司救了她，便相约他出来吃东西希望报答他，而真司和美穗的感情亦得以发展，可惜这个美好时刻却被邪恶的假面骑士龙牙破坏。镜中世界的真司假冒真正的真司袭击美穗，美穗与龙牙战斗但处于下风，虽然美穗被真司所救，但最后因伤重而死…

战兔创造了新世界后，除了战兔和龙我外，所有人都失去了有关假面骑士、天空之壁等的一切记忆。然而某一天，突然从白色的潘多拉金属板中出现了一个未知的外星生命体，他利用龙我恢复了潘多拉魔盒，并企图利用魔盒的力量毁灭全宇宙，而拯救宇宙的重任竟落在了龙我和埃伯尔特的身上！

在桐生战兔创造的新世界中，只有接受过人体实验的人恢复了旧世界的记忆。而某位恢复了记忆的科学家成立了覆灭组织，并突袭了政府官邸，他企图利用骑士系统来统治新世界。 另外，覆灭组织利用一股不可思议的力量让冰室幻德、桐生战兔、万丈龙我失去了变身能力，并为了夺得白色金属板，而绑架了美空。现在唯一的希望就在还能变身的一海身上了。 一海将燃烧心火、救回美空，最后的狂欢就此开始！